30 décembre 1993. Signature, à Jérusalem, de l'« Accord fondamental », qui entre en vigueur le 10 mars 1994. Il reconnaît la liberté de religion et de conscience et la liberté de l'Église catholique de remplir sa mission en Israël, qui est reconnu comme État par le Saint-Siège. Il prévoit également un accord ultérieur « sur des problèmes de propriété et des questions économiques et fiscales concernant l'Église catholique en général, ou des institutions ou communautés catholiques particulières ».
Juin 1994. Mise en place de relations diplomatiques entre le Saint-Siège et l'État d'Israël.
10 Novembre 1997. Signature d'un nouvel accord garantissant la pleine reconnaissance de la personnalité juridique de l'Église et des organismes ecclésiastiques.
1999. Début de discussions sur les questions financières et fiscales encore en suspens, et sur l'obtention ou le renouvellement des visas de longue durée pour les prêtres et religieux non israéliens (en vue de la poursuite d'études ou pour exercer un ministère en Terre sainte)
21-26 mars 2000. Visite de Jean-Paul II en Israël.
11-15 mai 2009. Visite de Benoît XVI en Israël.